Quando conectado em um navegador, as teclas Win, Esc (bem como Alt+Tab, Ctrl+Shift+Esc e outras) não podem ser captadas, assim, quando elas são utilizadas, há certa resposta tanto nos computadores remotos como nos locais que dificulta muito o trabalho dos operadores profissionais.

A a principal diferença e vantagem é que ao conectar-se a partir do painel de controle, a conexão é feita dentro do aplicativo desktop, o que permite que o manuseio das teclas seja interceptado e executado apenas no computador remoto.

A nível de aparência, a janela de conexão difere apenas na ausência das guias do navegador e da barra de endereço.